政事堂设在含和殿后的遐瞩楼，它的所在地可谓一半在总统府，一半在旧国务院。印铸局本就在院外。政事堂左为机要局，右为左右丞休息所，政事堂公所则是旧国务院址。
政事堂之组织细则为
（一）国务卿有参与军事之权，军事会议国务卿应列席。
（二）对外公事均以政事堂名义行之。
（三）国务卿在政事堂范围内应发堂谕。
（四）国务卿可召集各部总长开政事堂会议。
从上述情况看，徐世昌这个国务卿其实是在主持政府的日常行政事务。
在法律上虽没有原国务总理的地位，但实质上的职权，远超出前此国务总理之上。这应该是因为徐世昌任国务卿的缘故，所谓因人而设事。
因为这些职权均来自总统的授权，而没有法律保障，如果总统不愿意，这些权力可随时收回。
各部除例行公事得自行办理之外，重要事项均须国务卿核准，各部总长对国务卿实际是从属关系。当时还有一项规定，即外交、内务、交通、财政、陆军五总长，规定每日必须谒见袁，谒见时由国务卿率领。
徐世昌对朋友说，国务卿的冗忙，并不下于清朝兼管各部的军机大臣。
这位老相国每天起身甚早，八点后盥洗完毕即办公，至九点钟即至总统府。至十点钟偕左右二丞杨士琦、钱能训入谒与袁世凯议论国事。十一点钟到政事堂办公，十二点钟午膳。有时陪袁世凯进餐，有时则和杨士琦、钱能训共食。下午二点钟休息，至四五点钟起办公到晚上十点钟。
政事堂下设机要局、主计局、铨叙局、法制局、印铸局、司务局六局。最忙的是机要局。机要局除了局长张一廏外，还有两位副手是冯学书和郭则云。
张一廏最勤，每天早上六点就开始办公。
杨士琦、钱能训二丞则七点上班，把张一廏整理出来的公事复核，然后向徐世昌呈阅。
张一廏和袁世凯的关系也很特殊，是深得袁世凯信任之人。
在此以前，梁士诒虽权倾一切，可张一廏也是一位红牌秘书。他不属哪一派系，据说徐世昌的出任国务卿，袁世凯、徐世昌之间的许多细节都是张一廏从中间联络。
主计局长吴廷燮，一向和徐世昌的关系很深，熟于政要和考据，文学见长，人们以道学先生目之。主计局是一个居高临下的财政机关，旧日总统府内的财政会议即合并于主计局。吴廷燮不是财政专家，出长主计，令人有才非所用之感。
吴廷燮有鉴及此，乃在财政考据方面发表“权威”意见，诸如中国田赋簿籍之数，税法因革之原，他都考之有据，还写了一本《清理财政考略》专书。
主计局设在怀仁堂，即清朝的仪鸾殿。
铨叙局、印铸局、法制局都是旧人，司务局是专办庶务，局长是曾随徐世昌在东三省的旧人吴芨孙。
徐世昌出山后，自有他的作法。他认为“为政不在多言”，过去阁员入阁之初，总是长篇大论的发表政见，结果则是一事无成，焦头烂额。
“如今大乱之后，惟求休息，所以不敢有新政发表，只求择可行的行之，不可行的不行。行而有成效的就是善政，相反的就是恶政”。
他说“如果大家讥笑我无所表现，我也不敢辞，今天大家拉我出来，或者就是因为我的这种特性。”
然而徐世昌的特性是什么呢？，很多人都说具体言之是“复古”！其实这可能有一定的误解成分。在晚清的重臣中，徐世昌决不是个顽固守旧之人，相反倒一直是求新变革的。
比如在戊戌维新中，他无疑属于维新派，只是因为识时务而没卷于其中。在立宪运动中，他不但是坚定的立宪派，而且是属于立宪派中的激进者。而
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